Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20917Q62457 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms