Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtmQ62388 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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