Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ss18Q62280 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ss18Q62280 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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