Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Kdm5dQ62240 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms