Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms