Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema3bQ62177 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms