Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprrQ62132 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprrQ62132 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms