Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrkciQ62074 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkciQ62074 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms