Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Odf1Q61999 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Odf1Q61999 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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