Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prg2Q61878 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prg2Q61878 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prg2Q61878 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prg2Q61878 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prg2Q61878 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prg2Q61878 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg2Q61878 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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