Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ifi47Q61635 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ifi47Q61635 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ifi47Q61635 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ifi47Q61635 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ifi47Q61635 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi47Q61635 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms