Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itm2aQ61500 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms