Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msi1Q61474 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms