Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms