Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1eQ61290 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms