Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd2Q61285 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms