Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms