Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Foxd3Q61060 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Foxd3Q61060 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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