Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift20Q61025 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms