Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JrkQ60976 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms