Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbbp7Q60973 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp7Q60973 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms