Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp4Q60972 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp4Q60972 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbbp4Q60972 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rbbp4Q60972 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rbbp4Q60972 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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