Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod1Q60867 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms