Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot7Q60809 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms