Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3Q60803 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms