Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mkrn3Q60764 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mkrn3Q60764 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms