Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClpbQ60649 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms