Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1h2Q60644 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms