Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CttnQ60598 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms