Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sema5bQ60519 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema5bQ60519 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms