Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a3Q5XF89 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms