Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms