Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SynrgQ5SV85 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynrgQ5SV85 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms