Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme4Q5SSW2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms