Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Utp18Q5SSI6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms