Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11487Q5RIS0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11487Q5RIS0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms