Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms