Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trim58Q5NCC9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trim58Q5NCC9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trim58Q5NCC9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trim58Q5NCC9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trim58Q5NCC9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trim58Q5NCC9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trim58Q5NCC9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim58Q5NCC9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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