Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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