Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20cQ5MJS3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam20cQ5MJS3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam20cQ5MJS3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms