Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf3Q5HZG4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf3Q5HZG4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms