Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem3Q5H8B9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Frem3Q5H8B9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms