Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms