Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nlrc3Q5DU56 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nlrc3Q5DU56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nlrc3Q5DU56 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nlrc3Q5DU56 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nlrc3Q5DU56 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms