Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc8bQ5DU41 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms