Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms