Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spag9Q58A65 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spag9Q58A65 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms