Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eme2Q56A04 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms