Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig2Q52KR2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrig2Q52KR2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrig2Q52KR2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrig2Q52KR2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrig2Q52KR2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrig2Q52KR2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms