Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spire1Q52KF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms